中国胸痛中心组织管理体系建立在中国胸痛中心联盟的统一管理下，在国家卫健委医政医管局的统一指导和授权下开展工作。全国胸痛中心工作将在中国胸痛中心联盟、中国胸痛中心认证工作委员会、中国心血管健康联盟、胸痛中心总部组织下实施。主要框架由决策层和执行层构成。决策层由中国胸痛中心专家委员会、中国胸痛中心监督委员会组成，执行层分为专家执行层和团队执行层。

专家委员会

主任委员：霍勇

监督委员会主任委员：葛均波

执行主任委员：方唯一

副主任委员：颜红兵、陈纪言、王伟民

委员：陈茂、陈玉国、陈韵岱、丛洪良、格桑罗布、葛雷、黄恺、黄岚、贾绍斌、荆全民、孔祥清、李保、李建平、李浪、李占全、刘斌、刘健、马依彤、聂绍平、钱菊英、石蓓、王建安、王景峰、吴明、薛伟珍、杨萍、袁祖贻、张瑞岩、赵东 （按拼音字母排序）

执行委员会

主任委员：向定成

副主任委员：于波、苏晞、王焱、王乐丰、徐亚伟

委员：边慧萍、蔡琳、曾秋堂、陈凤英、陈良龙、陈小平、程晓曙、董少红、范觉新、傅向华、高传玉、关怀敏、韩冰、贺玉泉、候爱洁、姜黔峰、姜铁民、蒋峻、金元哲、李春洁、李国庆、李丽君、李伟、李治红、刘峰、刘惠亮、刘强、卢一郡、陆士娟、罗素新、马根山、马礼坤、马翔、秦伟毅、沙勇、沈成兴、沈密、苏国海、孙玉红、唐柚青、陶剑虹、魏庆民、吴延庆、伍贵富、许官学、杨丽霞、杨清、杨志明、尹作民、余宏伟、张立、张邢炜、张钲、赵兴胜、郑昭芬、郑杨、朱莉 （按拼音字母排序）

秘书长：曲新凯